Pirmojo asmens šaudyklė Rainbow Six Siege žaidimas leidžia dalyvauti skirtingiems sporto lygos operatoriams. Žaidėjai valdo virtualius operatorius su skirtingomis tautybėmis, įtaisais ir ginklais. Esant asimetrinei struktūrai, komandos gali negauti vienodų gebėjimų. Kovos su terorizmu padaliniai žaidime vadinami FTB SWAT ir gelbsti amerikiečių įkaitus.
Tarp gynėjų ir puolėjų taip pat yra vokiečių GSG-9, britų SAS, prancūzų GIGN ir Rusijos Spetsnaz. Kiekviename vienete yra operatoriams. Žaidėjai gali samdyti operatorių, turintį galimybę pasirinkti įrangą ir gebėjimus. Nauji operatoriai pasirenkami turo pradžioje. Pirkimas žaidime leidžia operatoriams nusipirkti kreditų kosmetikos gaminiams, greičiau įsigyti operatorių ar ginklus.
Prasidėjus raundui, puolėjai pasirenka pradinius taškus, kad galėtų pradėti puolimą, o gynėjai taip pat nusprendžia gynybos strategiją. Per trumpą pasiruošimo laiką užpuolikai valdo dronus, kad galėtų ieškoti opozicijos operatorių, sąrankų, taikinių ir spąstų. Žemėlapiai leidžia kovoti iš arti, tik pasibaigus raundui.
Žaidėjai, kurių veikėjai miršta žaidimo metu, gali naudoti palaikymo režimą, kad pasiektų droną ir apsaugos kameras bei praneštų savo komandai apie priešo veiklą ir vietas. Atsitiktinės rungtynės trunka keturias minutes, o reitinguotos – tris minutes. R6 žaidėjams būtinas komandinis darbas, norint nugalėti priešininkų komandą. Bendraudamas su kiekvienu komandos žaidėju komandos narys gali visapusiškai panaudoti savo sugebėjimus ir pasiekti tikslą.
Žiūrovų režimu žaidėjas gali stebėti skirtingus rungtynių kampus. Tiesą sakant, žaidime didelis dėmesys skiriamas aplinkos naikinimui. Žaidėjai naikina konstrukcijas sprogmenimis ar kulkomis. Sunaikinusi aplinką, komanda gali įgyti priešo pranašumą. Žaidėjai, kurie žaidime naudoja kūrybiškumą ir strategiją, gali geriau naršyti sistemoje. Žaidimo ypatybės apima įsiskverbimo sistemą, kuri mažiau kenkia priešui, kai kulkos praeina pro konstrukcijas.
Ginančios komandos gali sutvirtinti sienas ir naudoti skydus apsaugai. Tačiau priešas gali pažeisti arba sunaikinti šias apsaugas sprogmenimis ir kitais įtaisais. Gynėjai naudoja spąstus, įskaitant spygliuotą vielą visame žemėlapyje. Žaidėjai gali replikuoti per langus, sugriauti grindis ir užpulti priešininkų komandą. Granatos ir užtaisai yra vertingi naikinimo įrankiai, kurių kiekis yra ribotas kiekviename raunde.